Soju i suncokret zakorovljuje slična korovna flora. Kako ih sijemo nešto kasnije, kad se tlo dovoljno zagrije, zajedno s ovim okopavinskim kulturama niču i toploljubive korovne vrste. Od jednogodišnjih širokolisnih korovnih vrsta u usjevima soje i suncokreta, kao i u ostalim okopavinskim usjevima, najčešće se javljaju: obična loboda, mnogosjemena loboda, dvornici, šćir, ambrozija, europski mračnjak, čičak, crna pomoćnica, kužnjak, sljezolika i dr. Korovne trave (koštan, muhari, svračica i proso) u usjevu se pojavljuju nešto kasnije od širokolisnih vrsta, kao i višegodišnje korovne vrste (osjak, slak, ladolež od širokolisnih, te pirika, divlji sirak i troskot od uskolisnih).
U soji su danas registrirana 24 herbicida na čijoj je osnovi formulirano 69- herbicidni pripravci. Od navedenog broja herbicida prije sjetve soje registriran je samo jedan, nakon sjetve a prije nicanja 11 herbicida. Nakon nicanja soje i korova 12 herbicida. U soncokretu je ukupno registriran 21 herbicid, odnosno 50 herbicidnih pripravaka. Većina ih se koristi nakon sjetve, a prije nicanja suncokreta (19 herbicida). Nakon nicanja suncokreta na hrvatskom tržištu zastupljen je samo jedan herbicid, odnosno pripravak (Pledge 50 WP).
Većina herbicida selektivnih u soji, selektivni su i u suncokretu te ih stoga zajednički prikazujemo u tablicama 2 i 4. Selektivne herbicidine pripravke za suzbijanje korova nakon nicanje soje prikazujemo u tablici 3.
Prije nicanja soje i suncokreta moguće je primijeniti herbicid trifluralin. Riječ je o hlapljivu herbicidu, pa ga nakon primjene treba plitko (5 – 8 cm) unijeti u tlo. Primjena prije sjetve kulture ima određene prednosti (bolji učinci u sušnijim područjima i sušnijim godinama). No i određene nedostatke (skuplja aplikacija). Trifluralin je namijenjen suzbijanju jednogodišnjih korovnih trava s određenim djelovanjem na neke širokolisne korove. Djelovanje se mora nadopuniti primjenom herbicida iz drugih dvaju rokova primjene, pa to poskupljuje zaštitu od korova.
