Proces zaštite naziva „Varaždinsko zelje“ oznakom izvornosti započeo je u svibnju 2011. godine kada je Udruga proizvođača povrća i voća „Zeljari“ općine Vidovec podnijela Ministarstvu poljoprivrede zahtjev za zaštitu naziva. U studenom 2011. godine Ministarstvo poljoprivrede donosi Rješenje o registraciji oznake izvornosti čime naziv „Varaždinsko zelje“ postaje zaštićen u Republici Hrvatskoj.
U lipnju 2013. godine Ministarstvo poljoprivrede uputilo je Europskoj komisiji zahtjev za registraciju naziva „Varaždinsko zelje“ oznakom izvornosti na razini Europske unije. Nakon provjere dostavljene dokumentacije, Europska komisija je 07. srpnja 2015. godine objavila u Službenom listu obavijest o podnesenom zahtjevu za registraciju naziva „Varaždinsko zelje“ čime je započelo tromjesečno razdoblje za podnošenje prigovora.
Dana 16. listopada 2015. godine Ministarstvo poljoprivrede obaviješteno je od strane Europske komisije o zaprimljenom prigovoru Republike Slovenije na Zahtjev za registraciju naziva „Varaždinsko zelje“.
Slovensko Ministarstvo poljoprivrede u svojem prigovoru navodi da bi registracija naziva „Varaždinsko zelje“ mogla biti u suprotnosti s člankom 10. stavkom 1. podstavcima b) i c) Uredbe (EU) br. 1151/2012 o sustavima kvalitete poljoprivrednih i prehrambenih proizvoda, ali nisu dostavili obrazloženje. Za dostavu obrazložene izjave, na što su se pozvali u svom prigovoru, imaju rok od dva mjeseca. Europska komisija će provjeriti opravdanost obrazloženog prigovora te o istome obavijestiti Republiku Hrvatsku odnosno Ministarstvo poljoprivrede.
Članci Uredbe na koje se poziva slovenska strana odnose se na nazive biljne sorte ili životinjske pasmine sa kojima registrirani naziv ne smije biti u suprotnosti, zatim na nazive koji mogu biti homonimi sa već registriranim nazivom te na moguću dugotrajnu uporabu žiga na proizvodu za koji se traži registracija naziva. Koji od ovih mogućih razloga Slovenija drži osnovom za prigovor, u ovom trenutku nemamo saznanja, za to će trebati pričekati njihovo obrazloženje uloženog prigovora.