Način prijave bolesti životinja reguliran je novim Pravilnikom, a stupio je na snagu u svibnju ove godine. Osim postupka prijave bolesti životinja Europskoj komisiji i drugim državama članicama EU, što je u nadležnosti Uprave za veterinarstvo, posebno je propisan postupak prijave i odjave zaraznih bolesti životinja na području naše zemlje. U skladu s time posjednik mora pri pojavi znakova bolesti i uginuća odmah i bez odgađanja izvijestiti doktora veterinarske medicine u veterinarskoj organizaciji.
Veterinar je dužan na svaku prijavu posjednika izaći na teren, obaviti veterinarski pregled životinje i utvrditi postoji li sumnja na zaraznu ili nametničku bolest. U slučaju sumnje i potvrde slučaja bolesti navedenih u Pravilniku veterinar je dužan u roku od 24 sata putem propisanih obrazaca izvijestiti Upravu za veterinarstvo i državnog veterinarskog inspektora u nadležnoj ispostavi veterinarskog ureda. Tjedno izvješće o mjestu izbijanja sadrži podatke o svim promjenama u mjestu izbijanja, provedenim mjerama te novim slučajevima bolesti na predmetnom mjestu izbijanja tijekom prethodnog tjedna, uključujući i nedjelju. Dostavlja ga ovlašteni veterinar Upravi za veterinarstvo i Upravi za veterinarske inspekcije, i to svaki tjedan do odjave mjesta izbijanja. Završno izvješće dostavlja se nadležnim veterinarskim upravama najkasnije 48 sati nakon odjave mjesta izbijanja, a podrazumijeva ukidanje svih mjera kontrole i iskorjenjivanja nakon što je od posljednjeg slučaja bolesti proteklo vrijeme najdulje inkubacije te provedeno završno čišćenje i dezinfekcija. Spomenutim Pravilnikom posebno su propisane i obveze dijagnostičkih laboratorija. Navedeni laboratoriji o pozitivnom ili negativnom rezultatu pretrage na bilo koju bolest iz Pravilnika moraju što prije izvijestiti Upravu za veterinarstvo, Upravu za veterinarske inspekcije, nadležnu ispostavu veterinarskog ureda i pošiljatelja. O pozitivnom rezultatu dijagnostičke pretrage na bilo koju zaraznu ili nametničku bolest životinja koja nije navedena u Pravilniku, laboratorij mora izvijestiti Upravu za veterinarstvo. Pravilnikom o izmjenama Pravilnika o načinu prijave bolesti životinja (NN 114/2011.) od 7. listopada 2011. godine na listu bolesti koje se moraju prijaviti u Republici Hrvatskoj dodane su bolesti ptica (influenca, klamidioza, kolera, marekova bolest, mikoplazmoza, Newcasteleska bolest, puluroza, rinotraheitis purana, salmoneloza, zarazni bronhitis kokoši i dr.).
